מעט מאוד כנסיות קתוליות נבנו במוסקבה האורתודוכסית. בנוסף, חלק מהכנסיות שהוקמו לפני המהפכה נקרעו בתקופה הסובייטית וטרם הוחזרו למאמינים. כיום ניתן לספור כנסיות וקפלה קתוליות בבירת רוסיה על יד אחת.
קתדרלת התפיסה ללא רבב של הבתולה מרי נמצאת במוסקבה ברחוב מלאיה גרוזינסקאיה. כנסייה באתר זה החלה להיבנות בשנת 1899, אז היו בעיר כ- 30 אלף קתולים, וברור שלא היו מספיק כנסיות. הבנייה מומנה בהתנדבות - בתרומות, כך שהבנייה התעכבה כמעט 12 שנים. הפתיחה הגדולה התקיימה בדצמבר 1911. הדיכוי של התקופה הסובייטית השפיע באופן מלא על כנסייה זו - בשנת 1938 הופסקו השירותים בה, הכומר נורה, הצריח והצריחים נהרסו, האורגן נהרס, וכמה מוסדות עברו לבניין המחולקים לארבע קומות. היוזם של תהליך החזרת הכנסייה למאמינים בשנות ה -90 של המאה הקודמת היה האגודה הקתולית במוסקבה "דום פולסקי". מאה שנים לאחר ייסוד הכנסייה באתר זה, בדצמבר 1999, הושלם שיקום המקדש, והוא קיבל מעמד של קתדרלה. ובשנת 2005 הותקן בו שוב עוגב - מתנה מהקתדרלה הלותרנית של באזל. כיום מתקיימים בו שירותים בשפות רבות - מסלאבית כנסייתית ועד ארמנית וקוריאנית.
במלאיה לוביאנקה במוסקבה נמצאת כנסיית סנט לואיס של הצרפתים עם שני אביי - רוסים וצרפתים. הוא נבנה ביוזמת ממשלת צרפת באישור הקיסרית קתרין השנייה. תהליך בניית המקדש החל בשנת 1789, וב- 24 בנובמבר 1835 הוא הוקדש בחגיגיות. השירותים האלוהיים בקתדרלה זו לא נעצרו גם בתקופה הסובייטית. במהלך השנים ביקרו במקדש הנשיאים הצרפתיים שארל דה גול וז'אק שיראק, הקנצלר הראשון של הרפובליקה הפדרלית של גרמניה קונרד אדנאואר והנשיא הפולני לך ולזה. ההמונים במקדש זה הם גם רב לשוניים, משתמשים ברוסית, צרפתית, אנגלית, איטלקית, ליטאית, וייטנאמית ולטינית.
יחסית לאחרונה, בשנת 2003, הוקצה לקהילת סנט אולגה בית תרבות במעבר קירוב. כאן הוחלט להקים את הכנסייה הרומית-קתולית של הנסיכה אולגה השווה-לשליחים. עבודות השיקום עדיין בעיצומן, אך זהו כבר מקדש מתפקד, שמקבל מדי יום קהילות.
במוסקבה יש גם את הקפלה של קהילת הקתולים הדוברים ספרדית-פורטוגזית בוולקוב ליין, את הקפלה של קהילת הקתולים הגרמנים בפרוספקט ורנדסקי והקפלה בקוטוזובסקי פרוספקט.